Полынный переулок расположен в поселке Гудрон Советского района. Застраивается с 1950-х годов. Внесен в реестр улиц и площадей Орска распоряжением городской администрации № 3345-р от 31.10.2002 года. Назван по имени целебной травы, широко распространенной в степном крае. В настоящее время в переулке находятся щитовые многоквартирные одноэтажные дома бывших предприятий СМП-313 и СМП-665.