Перекопский переулок расположен в центральной части (внутри квартала, к северу от улицы Кантемировской) поселка Первомайский Ленинского района. Начал застраиваться в 1940-е годы. Назван по имени Перекопского перешейка, соединяющего полуостров Крым с материком, где во время Гражданской войны, благодаря водному маневру, была сломлена оборона войск Врангеля. В настоящее время в переулке расположен частный сектор из 13-ти деревянных, кирпичных, шлакоблочных одноэтажных жилых домов.